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PROTEUS, c’est ainsi que se nomme le projet d’intelligence artificielle biologique qui évolue dans des cellules vivantes. Des molécules créées sur-mesure en quelques semaines, et des protéines capables de résoudre des problèmes génétiques complexes…
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En Australie, des chercheurs ont mis au point PROTEUS. C’est un système capable de faire évoluer des protéines à l’intérieur même des cellules de mammifères. Ce procédé repose sur une méthode scientifique qui accélère les cycles de mutation et de sélection naturelle. Avec cette intelligence artificielle biologique, les scientifiques peuvent reprogrammer le vivant pour résoudre des problèmes de santé plus complexes.
Une intelligence artificielle biologique qui ne vit pas dans des puces en silicium
Bienvenue dans le monde de PROTein Evolution Using Selection, un système qui combine biotechnologie, évolution accélérée et IA pour créer des molécules sur-mesure, et cela directement dans nos cellules.
Ce système a été mis au point par des chercheurs du Centre Charles Perkins de l’Université de Sydney. Son but est de simuler rapidement l’évolution. Là où la nature mettrait des années, PROTEUS produit des molécules aux fonctions nouvelles ou optimisées en quelques semaines seulement.
Vous vous demandez comment ? C’est grâce à un concept appelé évolution dirigée. Par exemple, les chercheurs posent une question « comment désactiver ce gène dangereux ? ». Ensuite, PROTEUS génère des millions de versions différentes d’une molécule, jusqu’à trouver celles qui fonctionnent le mieux.
Par ailleurs, les chercheurs ont dû éviter un piège ! Que la cellule triche et trouve un raccourci juste pour passer l’essai. Pour cela, ils ont utilisé des particules virales chimériques afin de garantir un vrai processus d’évolution. C’est une sorte de combinaison entre deux virus très différents. Cela donne ensuite un système robuste, stable, et déjà validé par d’autres labos.
New paper from our lab @amitsake @CPC_usyd@Sydney_Science , we built a directed evolution system (PROTEUS) that works like biological AI. You can use it to make RNA or proteins with new or enhanced functions.https://t.co/R1sFiwsfFT#ProteinDesign #AI #SyntheticBiology
— Greg Neely (@Neely_Lab) July 7, 2025
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Des cellules de mammifères comme environnement d’expérimentation
Le plus impressionnant, c’est que cette intelligence artificielle biologique ne bosse pas dans des bactéries (comme c’était le cas jusqu’ici). Elle s’élabore directement dans des cellules de mammifères, un environnement qui ressemble à celui de notre propre corps.
Moi, je trouve que ce projet est énorme, car il ouvre la voie à des thérapies plus efficaces, mieux ciblées, et à des médicaments que l’on ne pourrait même pas envisager aujourd’hui avec les outils classiques.
Selon le professeur Greg Neely, co-auteur du projet, PROTEUS pourrait améliorer les technologies comme CRISPR et aussi la détection des dommages à l’ADN (un facteur clé du cancer). Cette intelligence artificielle biologique peut également concevoir des protéines plus facilement contrôlables par des médicaments.
En plus, les créateurs de PROTEUS ont rendu leur système open source. Autrement dit, n’importe quel laboratoire dans le monde peut l’utiliser, l’améliorer et l’adapter. Ces scientifiques ne veulent rien de moins que créer une nouvelle génération d’enzymes, d’outils génétiques et de traitements personnalisés, à base d’ARNm ou autres technologies de pointe.
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